Formation au séquençage de Adjo Seyram Comlan, biologiste du laboratoire partenaire togolais BIOLIM

Formation au séquençage de Adjo Seyram Comlan, biologiste du laboratoire partenaire togolais BIOLIM

Dans le cadre du projet AFROSCREEN, un volet Formations en laboratoire est destiné à renforcer les capacités des laboratoires des pays partenaires, notamment dans le domaine du criblage des mutations du SARS-CoV-2.
Retour sur la formation au séquençage du laboratoire partenaire togolais BIOLIM, organisée d’octobre à décembre 2021, au sein du laboratoire de l’Unité Mixte Internationale TransVIHMI à Montpellier.

Ajdo Seyram Comlan en activité sur la plateforme NGS du laboratoire de l’UMI TransVIHMI

Ajdo Seyram Comlan en activité sur la plateforme NGS du laboratoire de l’UMI TransVIHMI

Pendant 2 mois, Adjo Seyram Comlan, biologiste au laboratoire BIOLIM, partenaire togolais d’AFROSCREEN, a été accueillie au sein du laboratoire de l’Unité Mixte Internationale TransVIHMI à Montpellier afin de recevoir une formation complète au séquençage sur la plateforme de NGS (Séquençage de nouvelle génération), et de mettre immédiatement en pratique les acquis en réalisant les séquences de 209 échantillons togolais prélevés entre mi-juillet à fin septembre 2021. Les analyses ont montré que tous les cas sont dus à des variants Delta.

Au terme de sa formation au sein de l’équipe montpelliéraine, et notamment auprès de Christelle Butel et Laetitia Serrano (biologistes), Nicolas Munoz Fernandez (bioinformaticien), Martine Peeters et Ahidjo Ayouba (virologues), Adjo Seyram Comlan est désormais parfaitement autonome pour mettre en place les activités de séquençage dans son laboratoire d’origine.

Adjo Seyram Comlan et Christelle Butel dans le laboratoire de séquençage de l’UMI TransVIHMI
Adjo Seyram Comlan et Christelle Butel dans le laboratoire de séquençage de l’UMI TransVIHMI

Dans le cadre du projet, le laboratoire BIOLIM est en charge de réaliser le séquençage et le criblage des mutations par PCR d’échantillons togolais, et de collecter et analyser des données épidémiologiques sur les échantillons qui relèvent la présence de variants préoccupants.

Le renforcement par AFROSCREEN des capacités de BIOLIM consiste non seulement en la formation de son personnel (formations au séquençage, au criblage par PCR, à l’analyse bio-informatique, à la phylogénie etc.), mais aussi en l’acquisition d’équipements, réactifs et consommables nécessaires à la réalisation des activités de laboratoire. Ainsi, BIOLIM se verra notamment doté courant du premier semestre 2022 d’un séquenceur NGS lui permettant de démarrer le séquençage du SARS-CoV-2, et à termes d’autres pathogènes émergeants.

A travers le projet AFROSCREEN et cette opportunité de formation sur un pas de temps long, c’est aussi le partenariat de l’IRD / UMR TransVIHMI et BIOLIM qui est durablement renforcé.

Ajdo Seyram Comlan en activité sur la plateforme NGS du laboratoire de l’UMI TransVIHMI

Pendant 2 mois, Adjo Seyram Comlan, biologiste au laboratoire BIOLIM, partenaire togolais d’AFROSCREEN, a été accueillie au sein du laboratoire de l’Unité Mixte Internationale TransVIHMI à Montpellier afin de recevoir une formation complète au séquençage sur la plateforme de NGS (Séquençage de nouvelle génération), et de mettre immédiatement en pratique les acquis en réalisant les séquences de 209 échantillons togolais prélevés entre mi-juillet à fin septembre 2021. Les analyses ont montré que tous les cas sont dus à des variants Delta.

Au terme de sa formation au sein de l’équipe montpelliéraine, et notamment auprès de Christelle Butel et Laetitia Serrano (biologistes), Nicolas Munoz Fernandez (bioinformaticien), Martine Peeters et Ahidjo Ayouba (virologues), Adjo Seyram Comlan est désormais parfaitement autonome pour mettre en place les activités de séquençage dans son laboratoire d’origine.

Adjo Seyram Comlan et Christelle Butel dans le laboratoire de séquençage de l’UMI TransVIHMI
Adjo Seyram Comlan et Christelle Butel dans le laboratoire de séquençage de l’UMI TransVIHMI

Dans le cadre du projet, le laboratoire BIOLIM est en charge de réaliser le séquençage et le criblage des mutations par PCR d’échantillons togolais, et de collecter et analyser des données épidémiologiques sur les échantillons qui relèvent la présence de variants préoccupants.

Le renforcement par AFROSCREEN des capacités de BIOLIM consiste non seulement en la formation de son personnel (formations au séquençage, au criblage par PCR, à l’analyse bio-informatique, à la phylogénie etc.), mais aussi en l’acquisition d’équipements, réactifs et consommables nécessaires à la réalisation des activités de laboratoire. Ainsi, BIOLIM se verra notamment doté courant du premier semestre 2022 d’un séquenceur NGS lui permettant de démarrer le séquençage du SARS-CoV-2, et à termes d’autres pathogènes émergeants.

A travers le projet AFROSCREEN et cette opportunité de formation sur un pas de temps long, c’est aussi le partenariat de l’IRD / UMR TransVIHMI et BIOLIM qui est durablement renforcé.

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