Formation au séquençage de Odilon Paterne Nouatin (IRCB) et Setondji Islamiath Kissira (IRCB – LFHV), partenaires béninois d’AFROSCREEN
Formation au séquençage de Odilon Paterne Nouatin (IRCB) et Setondji Islamiath Kissira (IRCB – LFHV), partenaires béninois d’AFROSCREEN
Dans le cadre du projet AFROSCREEN, un volet Formations en laboratoire est destiné à renforcer les capacités des laboratoires des pays partenaires, notamment dans le domaine du séquençage.
Retour sur la formation au séquençage des laboratoires partenaires béninois IRCB et LFHV, organisée de février à avril 2022, au sein du laboratoire de l’Unité Mixte Internationale (UMI) TransVIHMI à Montpellier.
Pendant 2 mois, Odilon Paterne Nouatin, biologiste au laboratoire IRCB (Institut de Recherche Clinique du Bénin), et Setondji Islamiath Kissira, ingénieure au LFHV (Laboratoire des Fièvres Hémorragiques Virales), tous les deux partenaires d’AFROSCREEN au Bénin, ont été accueillis au sein du laboratoire de l’UMI TransVIHMI à Montpellier afin de recevoir une formation complète au séquençage du SARS-Cov-2 sur la plateforme de NGS (Séquençage de nouvelle génération), et de mettre immédiatement en pratique les acquis en réalisant les séquences d’environ 200 échantillons béninois prélevés entre mi-décembre 2021 et début Janvier 2022 dans 6 des 12 départements du Bénin. Ces analyses rétrospectives ont permis d’identifier qu’Omicron circulait déjà dans le pays avant l’arrivée de la 4ème vague qui était liée à ce variant, confirmant ainsi l’importance de la mise en place d’une surveillance génomique nationale pour anticiper l’émergence de nouveaux variants liés à l’épidémie de Covid-19.
Au terme de leur formation au sein de l’équipe montpelliéraine, et notamment auprès de Christelle Butel et Laetitia Serrano (ingénieures), Nicolas Muñoz Fernandez (bioinformaticien), Ahidjo Ayouba et Martine Peeters (virologues), Odilon Paterne Nouatin et Setondji Islamiath Kissira sont désormais autonomes pour mettre en place les activités de séquençage du SARS-CoV-2 qui seront réalisées à l’IRCB avec l’appui du LFHV.
Dans le cadre du projet, au Bénin, le LFHV est en charge de réaliser le criblage des mutations par PCR d’échantillons béninois et l’IRCB est en charge de réaliser le séquençage et de collecter et analyser des données épidémiologiques sur les échantillons dans lesquels on relèvera la présence de variants préoccupants.
A travers le projet AFROSCREEN et cette opportunité de formation sur un pas de temps long, c’est aussi le partenariat de l’IRD (au travers les deux unités de recherche TransVIHMI MERIT) et l’IRCB et le LFHV qui est durablement renforcé.
Odilon Paterne Nouatin en activité sur la plateforme NGS du laboratoire de l’UMI TransVIHMI
Pendant 2 mois, Odilon Paterne Nouatin, biologiste au laboratoire IRCB (Institut de Recherche Clinique du Bénin), et Setondji Islamiath Kissira, ingénieure au LFHV (Laboratoire des Fièvres Hémorragiques Virales), tous les deux partenaires d’AFROSCREEN au Bénin, ont été accueillis au sein du laboratoire de l’UMI TransVIHMI à Montpellier afin de recevoir une formation complète au séquençage du SARS-Cov-2 sur la plateforme de NGS (Séquençage de nouvelle génération), et de mettre immédiatement en pratique les acquis en réalisant les séquences d’environ 200 échantillons béninois prélevés entre mi-décembre 2021 et début Janvier 2022 dans 6 des 12 départements du Bénin. Ces analyses rétrospectives ont permis d’identifier qu’Omicron circulait déjà dans le pays avant l’arrivée de la 4ème vague qui était liée à ce variant, confirmant ainsi l’importance de la mise en place d’une surveillance génomique nationale pour anticiper l’émergence de nouveaux variants liés à l’épidémie de Covid-19.
Au terme de leur formation au sein de l’équipe montpelliéraine, et notamment auprès de Christelle Butel et Laetitia Serrano (ingénieures), Nicolas Muñoz Fernandez (bioinformaticien), Ahidjo Ayouba et Martine Peeters (virologues), Odilon Paterne Nouatin et Setondji Islamiath Kissira sont désormais autonomes pour mettre en place les activités de séquençage du SARS-CoV-2 qui seront réalisées à l’IRCB avec l’appui du LFHV.
Dans le cadre du projet, au Bénin, le LFHV est en charge de réaliser le criblage des mutations par PCR d’échantillons béninois et l’IRCB est en charge de réaliser le séquençage et de collecter et analyser des données épidémiologiques sur les échantillons dans lesquels on relèvera la présence de variants préoccupants.
A travers le projet AFROSCREEN et cette opportunité de formation sur un pas de temps long, c’est aussi le partenariat de l’IRD (au travers les deux unités de recherche TransVIHMI MERIT) et l’IRCB et le LFHV qui est durablement renforcé.
Odilon Paterne Nouatin en activité sur la plateforme NGS du laboratoire de l’UMI TransVIHMI