Renforcement des capacités du Laboratoire Bactériologie-Virologie du CHU de Fann
Renforcement des capacités du Laboratoire Bactériologie-Virologie du CHU de Fann
Dans le cadre du renforcement des capacités de séquençage et de surveillance génomique du SARS-CoV-2 et des pathogènes émergents en Afrique de l’Ouest et Centrale, le projet AFROSCREEN soutien 3 structures de santé au Sénégal : le centre hospitalier université de Fann, l’hôpital Dalal Jamm et l’Institut Pasteur de Dakar.
Le Laboratoire de Bactériologie-Virologie du service de Pneumologie du CHU de Fann a bénéficié d’un renforcement de capacité pour la réalisation des tests de séquençage avec trois volets : (i) des travaux d’aménagement au niveau du laboratoire, (ii) l’acquisition d’un séquenceur et d’équipement (iii) et la formation du personnel sur le séquençage.
Des travaux d’aménagement ont été entrepris au niveau du Laboratoire de Bactériologie-Virologie du service de Pneumologie du CHU de Fann pour pouvoir répondre aux normes pour la réalisation des activités de biologie moléculaire. Ainsi, des cloisonnements ont été effectués au niveau des anciens locaux pour pouvoir disposer d’une salle de prélèvement, d’une salle d’extraction, d’une salle de préparation des mix de PCR, d’une salle d’amplification et d’une salle de séquençage.
Par la suite, le projet AFROSCREEN a fourni au laboratoire un séquenceur de type iSeq 100 (Illumina) et des équipements pour la réalisation des tests de biologie moléculaire, notamment des hottes, centrifugeuse, congélateur, jeux de pipettes, etc.
Au courant du mois d’octobre 2023, le groupe SSM, distributeur d’Illumina au Sénégal, a procédé à l’installation et la formation du personnel sur le séquençage. La formation a été effectuée en deux parties :
- Une première partie théorique qui consistait à donner les orientations, les principes et les méthodologies qui sont utilisées pour la réalisation des tests de séquençage par Illumina.
- Une deuxième phase pratique a été effectuée au niveau du laboratoire avec la réalisation des tests sous la supervision de l’ingénieur de SSM.
A la fin de la formation, une évaluation des connaissances a été faite par le formateur. Une évaluation de la formation a aussi été faite par le personnel formé pour apprécier le niveau de la formation.
Le renforcement de capacités va permettre au Laboratoire de Bactériologie-Virologie du CHU de Fann de décrire en rétrospective, la circulation des variants du SARS-CoV-2 durant la période de pandémique, grâce aux prélèvements qui ont été effectués au laboratoire. En outre, le laboratoire va pouvoir effectuer le séquençage des infections chroniques, telles que le VIH et les hépatites virales, mais aussi la surveillance génomique de la résistance aux antimicrobiens et des pathogènes émergents.
Dans le cadre du renforcement des capacités de séquençage et de surveillance génomique du SARS-CoV-2 et des pathogènes émergents en Afrique de l’Ouest et Centrale, le projet AFROSCREEN soutien 3 structures de santé au Sénégal : le centre hospitalier université de Fann, l’hôpital Dalal Jamm et l’Institut Pasteur de Dakar.
Le Laboratoire de Bactériologie-Virologie du service de Pneumologie du CHU de Fann a bénéficié d’un renforcement de capacité pour la réalisation des tests de séquençage avec trois volets : (i) des travaux d’aménagement au niveau du laboratoire, (ii) l’acquisition d’un séquenceur et d’équipement (iii) et la formation du personnel sur le séquençage.
Des travaux d’aménagement ont été entrepris au niveau du Laboratoire de Bactériologie-Virologie du service de Pneumologie du CHU de Fann pour pouvoir répondre aux normes pour la réalisation des activités de biologie moléculaire. Ainsi, des cloisonnements ont été effectués au niveau des anciens locaux pour pouvoir disposer d’une salle de prélèvement, d’une salle d’extraction, d’une salle de préparation des mix de PCR, d’une salle d’amplification et d’une salle de séquençage.
Par la suite, le projet AFROSCREEN a fourni au laboratoire un séquenceur de type iSeq 100 (Illumina) et des équipements pour la réalisation des tests de biologie moléculaire, notamment des hottes, centrifugeuse, congélateur, jeux de pipettes, etc.
Au courant du mois d’octobre 2023, le groupe SSM, distributeur d’Illumina au Sénégal, a procédé à l’installation et la formation du personnel sur le séquençage. La formation a été effectuée en deux parties :
- Une première partie théorique qui consistait à donner les orientations, les principes et les méthodologies qui sont utilisées pour la réalisation des tests de séquençage par Illumina.
- Une deuxième phase pratique a été effectuée au niveau du laboratoire avec la réalisation des tests sous la supervision de l’ingénieur de SSM.
A la fin de la formation, une évaluation des connaissances a été faite par le formateur. Une évaluation de la formation a aussi été faite par le personnel formé pour apprécier le niveau de la formation.
Le renforcement de capacités va permettre au Laboratoire de Bactériologie-Virologie du CHU de Fann de décrire en rétrospective, la circulation des variants du SARS-CoV-2 durant la période de pandémique, grâce aux prélèvements qui ont été effectués au laboratoire. En outre, le laboratoire va pouvoir effectuer le séquençage des infections chroniques, telles que le VIH et les hépatites virales, mais aussi la surveillance génomique de la résistance aux antimicrobiens et des pathogènes émergents.