Retour sur le webinaire : « Apport de la surveillance génomique dans la gestion des épidémies en RDC de 2018 à nos jours »
Retour sur le webinaire : « Apport de la surveillance génomique dans la gestion des épidémies en RDC de 2018 à nos jours »
Le Dr Amuri Aziza Adrienne, Biologiste Médicale, et le Dr Kinganda Lusamaki Eddy, Médecin Biologiste, du Laboratoire de Génomique des Pathogènes de l’Institut National de Recherche Biomédicale (INRB), Kinshasa, République Démocratique du Congo nous ont présenté l’apport de la surveillance génomique dans la gestion des épidémies en République Démocratique du Congo de 2018 à nos jours.
Etant donnée l’étendue de sa superficie, la RDC a dû faire face à plusieurs épidémies, parfois concomitantes depuis 2018 : Ebola, Covid-19, Monkeypox, peste, mais aussi rougeole, fièvre jaune, entre autres.
Le Dr Amuri Aziza nous a parlé de l’installation de la première plateforme de séquençage à Kinshasa en 2018, pendant la 9ème épidémie d’Ebola et a insisté sur l’importance de pouvoir déployer des laboratoires mobiles ou installer des plateformes de séquençage dans différentes provinces, afin de renforcer les capacités de la RDC en terme de préparation aux épidémies. Aujourd’hui, deux laboratoires de génomique de pathogènes sont opérationnels en RDC : à Kinshasa et au Nord Kivu. Et le laboratoire de l’INRB a été réhabilité grâce à un financement et a été visité par le Président Macron en avril 2023. Une nouvelle implémentation est en cours à Lubumbashi dans le sud du pays. L’objectif est d’étendre et de répartir la présence de ces laboratoires dans les zones stratégiques de la RDC afin de pouvoir séquencer localement lors d’épidémies.
A l’INRB, le séquençage est fait en routine pour 6 pathogènes : la polio, la rougeole, Ebola, Monkeypox, le Covid-19, la peste, et les activités vont prochainement être étendues pour le plasmodium, le VIH et le choléra.
Le Dr Amuri Aziza a présenté différents exemples démontrant l’importance du séquençage, notamment dans la réponse aux épidémies du virus Ebola qui se sont succédées depuis 2018, comme d’autres épidémies.
En effet, la 9ème épidémie Ebola dans la province Equateur en 2018 a pris fin lorsque la 10ème, la plus importante à ce jour en RDC, a été déclarée dans la province Nord Kivu. Le séquençage des échantillons a permis de confirmer qu’il s’agissait de deux épidémies différentes. En outre, les travaux de séquençage menés pendant deux ans au Nord Kivu, dans un contexte de guerre et d’insécurité, ont donné lieu à différentes publications (“Integration of genomic sequencing into the response to the Ebola virus outbreak in Nord Kivu, Democratic Republic of the Congo”, Nature Medicine et “Ebola Virus Transmission Initiated by Relapse of Systemic Ebola Virus Disease” The New England Journal of Medicine).
Par ailleurs, le Dr Amuri Aziza a insisté sur le suivi de l’évolution de l’épidémie de Covid-19 en RDC, qui connaît actuellement une 6ème vague, avec un nombre élevé de cas.
Au sujet de Monkeypox, depuis 2020, des notifications apparaissent dans de nouvelles provinces qui n’étaient pas touchées auparavant. Aujourd’hui, 20 des 26 provinces de RDC rencontrent des cas positifs de Monkeypox, et la production de beaucoup d’échantillons pose la question du stockage.
Dans une seconde partie du webinaire, le Dr Kinganda Lusamaki Eddy nous a présenté la création d’une biobanque à l’INRB, capable de stocker des organismes hautement pathogènes, en garantissant la biosûreté et la biosécurité avec le stockage de 400 000 échantillons à ce jour (Ebola, SARS-CoV-2, échantillons dérivés de la faune et de la surveillance sentinelle humaine, etc.).
Le Dr Kinganda Lusamaki Eddy a insisté sur l’importance de différents facteurs pour le fonctionnement de la biobanque :
- Un système pour maintenir la fourniture d’énergie électrique
- Un système pour monitorer de la température des freezers
- Un système de gestion des échantillons
Pour finir, le Dr Kinganda Lusamaki Eddy a insisté sur l’importance de la fourniture de réactifs, de l’entretien, la réparation et le remplacement des équipements, de la formation des équipes, ainsi que du développement et les collaborations avec d’autres équipes scientifiques et consortiums dans le monde entier afin de pourvoir continuer la préparation aux épidémies.
Pour en savoir plus, retrouvez l’intégralité du webinaire : https://www.youtube.com/watch?v=nuLbi-IwPTs
Etant donnée l’étendue de sa superficie, la RDC a dû faire face à plusieurs épidémies, parfois concomitantes depuis 2018 : Ebola, Covid-19, Monkeypox, peste, mais aussi rougeole, fièvre jaune, entre autres.
Le Dr Amuri Aziza nous a parlé de l’installation de la première plateforme de séquençage à Kinshasa en 2018, pendant la 9ème épidémie d’Ebola et a insisté sur l’importance de pouvoir déployer des laboratoires mobiles ou installer des plateformes de séquençage dans différentes provinces, afin de renforcer les capacités de la RDC en terme de préparation aux épidémies. Aujourd’hui, deux laboratoires de génomique de pathogènes sont opérationnels en RDC : à Kinshasa et au Nord Kivu. Et le laboratoire de l’INRB a été réhabilité grâce à un financement et a été visité par le Président Macron en avril 2023. Une nouvelle implémentation est en cours à Lubumbashi dans le sud du pays. L’objectif est d’étendre et de répartir la présence de ces laboratoires dans les zones stratégiques de la RDC afin de pouvoir séquencer localement lors d’épidémies.
A l’INRB, le séquençage est fait en routine pour 6 pathogènes : la polio, la rougeole, Ebola, Monkeypox, le Covid-19, la peste, et les activités vont prochainement être étendues pour le plasmodium, le VIH et le choléra.
Le Dr Amuri Aziza a présenté différents exemples démontrant l’importance du séquençage, notamment dans la réponse aux épidémies du virus Ebola qui se sont succédées depuis 2018, comme d’autres épidémies.
En effet, la 9ème épidémie Ebola dans la province Equateur en 2018 a pris fin lorsque la 10ème, la plus importante à ce jour en RDC, a été déclarée dans la province Nord Kivu. Le séquençage des échantillons a permis de confirmer qu’il s’agissait de deux épidémies différentes. En outre, les travaux de séquençage menés pendant deux ans au Nord Kivu, dans un contexte de guerre et d’insécurité, ont donné lieu à différentes publications (“Integration of genomic sequencing into the response to the Ebola virus outbreak in Nord Kivu, Democratic Republic of the Congo”, Nature Medicine et “Ebola Virus Transmission Initiated by Relapse of Systemic Ebola Virus Disease” The New England Journal of Medicine).
Par ailleurs, le Dr Amuri Aziza a insisté sur le suivi de l’évolution de l’épidémie de Covid-19 en RDC, qui connaît actuellement une 6ème vague, avec un nombre élevé de cas.
Au sujet de Monkeypox, depuis 2020, des notifications apparaissent dans de nouvelles provinces qui n’étaient pas touchées auparavant. Aujourd’hui, 20 des 26 provinces de RDC rencontrent des cas positifs de Monkeypox, et la production de beaucoup d’échantillons pose la question du stockage.
Dans une seconde partie du webinaire, le Dr Kinganda Lusamaki Eddy nous a présenté la création d’une biobanque à l’INRB, capable de stocker des organismes hautement pathogènes, en garantissant la biosûreté et la biosécurité avec le stockage de 400 000 échantillons à ce jour (Ebola, SARS-CoV-2, échantillons dérivés de la faune et de la surveillance sentinelle humaine, etc.).
Le Dr Kinganda Lusamaki Eddy a insisté sur l’importance de différents facteurs pour le fonctionnement de la biobanque :
- Un système pour maintenir la fourniture d’énergie électrique
- Un système pour monitorer de la température des freezers
- Un système de gestion des échantillons
Pour finir, le Dr Kinganda Lusamaki Eddy a insisté sur l’importance de la fourniture de réactifs, de l’entretien, la réparation et le remplacement des équipements, de la formation des équipes, ainsi que du développement et les collaborations avec d’autres équipes scientifiques et consortiums dans le monde entier afin de pourvoir continuer la préparation aux épidémies.
Pour en savoir plus, retrouvez l’intégralité du webinaire : https://www.youtube.com/watch?v=nuLbi-IwPTs