Une formation au séquençage organisée en Février 2022

Une formation au séquençage organisée en Février 2022

Dans le cadre du projet AFROSCREEN, plusieurs formations en laboratoire sont prévues, afin de renforcer les capacités des laboratoires des pays partenaires, notamment dans le domaine du séquençage.
Retour sur une formation organisée en Février 2022, au sein de la plateforme génomique du CHU Henri Mondor (AP-HP), à Paris.

Une formation au séquençage organisée en Février

Pendant 3 semaines, six participants – Pr. Lamine DIA (CHU de FANN, Sénégal), Dr. Fatoumata Diallo (CHU de FANN, Sénégal), Dr. Ibrehima Guindo (INSP, Mali), Dr. Noumou Yacouba Keita (INSP, Mali), Dr. Dramane Kania (Centre Muraz, Burkina-Faso) et Dr. Arsène Zongo (Centre Muraz, Burkina-Faso) – scientifiques au sein des laboratoires partenaires du projet, ont été accueillis par l’ANRS | Maladies infectieuses émergentes au sein de la plateforme génomique du CHU Henri Mondor à Paris pour une formation.

L’objectif de cette formation était de permettre de renforcer les capacités de séquençage des six participants : la réalisation de tous les étapes du séquençage du SARS-CoV2 sur la plateforme NGS qui sera mise à disposition par le projet, et de l’analyse bio-informatique subséquentes pour l’obtention de la séquence génomique finale et la soumission à GISAID, la plateforme publique et gratuite de partage des séquences à niveau mondial.

séquençage

Dans le cadre du projet, plusieurs équipements de séquençage vont être acheminés dans les différents laboratoires partenaires. Cette formation a permis aux scientifiques de se familiariser avec ces modèles de machines, afin d’être opérationnels dès la réception des équipements et des consommables.

Les participants ont également pu travailler sur des échantillons de leurs propres pays, acheminés pour l’occasion. Cela leur a permis d’obtenir des données profitables, qu’ils ont pu envoyer aux Ministères de la Santé.

De retours dans leur laboratoire, les participants pourront également former leurs équipes à ces nouvelles techniques.

Un grand merci aux participants d’avoir assisté à cette formation ainsi qu’à l’équipe du CHU Henri Mondor pour son accueil et son accompagnement pendant ces 3 semaines de formation et à Science Accueil, partenaire de l’ANRS | Maladies infectieuses émergentes, qui a assuré la logistique de l’accueil, le suivi et l’accompagnement des scientifiques tout au long de la formation.

Séquençage

 

Pour en savoir plus, retrouvez les interviews de deux participants :

Pendant 3 semaines, six participants – Pr. Lamine DIA (CHU de FANN, Sénégal), Dr. Fatoumata Diallo (CHU de FANN, Sénégal), Dr. Ibrehima Guindo (INSP, Mali), Dr. Noumou Yacouba Keita (INSP, Mali), Dr. Dramane Kania (Centre Muraz, Burkina-Faso) et Dr. Arsène Zongo (Centre Muraz, Burkina-Faso) – scientifiques au sein des laboratoires partenaires du projet, ont été accueillis par l’ANRS | Maladies infectieuses émergentes au sein de la plateforme génomique du CHU Henri Mondor à Paris pour une formation.

L’objectif de cette formation était de permettre de renforcer les capacités de séquençage des six participants : la réalisation de tous les étapes du séquençage du SARS-CoV2 sur la plateforme NGS qui sera mise à disposition par le projet, et de l’analyse bio-informatique subséquentes pour l’obtention de la séquence génomique finale et la soumission à GISAID, la plateforme publique et gratuite de partage des séquences à niveau mondial.

séquençage

Dans le cadre du projet, plusieurs équipements de séquençage vont être acheminés dans les différents laboratoires partenaires. Cette formation a permis aux scientifiques de se familiariser avec ces modèles de machines, afin d’être opérationnels dès la réception des équipements et des consommables.

Les participants ont également pu travailler sur des échantillons de leurs propres pays, acheminés pour l’occasion. Cela leur a permis d’obtenir des données profitables, qu’ils ont pu envoyer aux Ministères de la Santé.

De retours dans leur laboratoire, les participants pourront également former leurs équipes à ces nouvelles techniques.

Un grand merci aux participants d’avoir assisté à cette formation ainsi qu’à l’équipe du CHU Henri Mondor pour son accueil et son accompagnement pendant ces 3 semaines de formation et à Science Accueil, partenaire de l’ANRS | Maladies infectieuses émergentes, qui a assuré la logistique de l’accueil, le suivi et l’accompagnement des scientifiques tout au long de la formation.

Séquençage

 

Pour en savoir plus, retrouvez les interviews de deux participants :

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